MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa M23 plasmid pXFAS01

Total Repeats: 730

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010579	TGGG	2	8	58	65	0 %	25 %	75 %	0 %	182682735
2	NC_010579	TG	3	6	97	102	0 %	50 %	50 %	0 %	182682735
3	NC_010579	GCA	2	6	135	140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682735
4	NC_010579	AAGA	2	8	182	189	75 %	0 %	25 %	0 %	182682735
5	NC_010579	TTA	2	6	248	253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182682735
6	NC_010579	CAA	2	6	278	283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182682735
7	NC_010579	AAT	2	6	319	324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182682735
8	NC_010579	TGC	2	6	354	359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682736
9	NC_010579	GTT	2	6	367	372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182682736
10	NC_010579	CTTG	2	8	373	380	0 %	50 %	25 %	25 %	182682736
11	NC_010579	ATC	2	6	414	419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682736
12	NC_010579	TCT	2	6	445	450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182682736
13	NC_010579	GAT	2	6	470	475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682736
14	NC_010579	CGT	2	6	510	515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682736
15	NC_010579	CAT	2	6	597	602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682736
16	NC_010579	GCA	2	6	698	703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682736
17	NC_010579	GAG	2	6	710	715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182682736
18	NC_010579	TTC	2	6	758	763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182682736
19	NC_010579	GTCACG	2	12	767	778	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	182682736
20	NC_010579	ATG	3	9	828	836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682736
21	NC_010579	CGCAC	2	10	860	869	20 %	0 %	20 %	60 %	182682736
22	NC_010579	ATC	2	6	1035	1040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682736
23	NC_010579	CGG	2	6	1084	1089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182682736
24	NC_010579	GGT	2	6	1221	1226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182682736
25	NC_010579	ATC	2	6	1248	1253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682736
26	NC_010579	TTC	2	6	1313	1318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182682736
27	NC_010579	TGG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182682736
28	NC_010579	TCA	2	6	1385	1390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682736
29	NC_010579	CTA	2	6	1429	1434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682736
30	NC_010579	TGA	2	6	1452	1457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682736
31	NC_010579	CGA	2	6	1490	1495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682736
32	NC_010579	CT	3	6	1570	1575	0 %	50 %	0 %	50 %	182682736
33	NC_010579	CGT	2	6	1601	1606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682736
34	NC_010579	TTG	2	6	1610	1615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182682736
35	NC_010579	CTG	2	6	1637	1642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682736
36	NC_010579	CCT	2	6	1694	1699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182682736
37	NC_010579	TGC	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682736
38	NC_010579	ATT	2	6	1784	1789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182682736
39	NC_010579	TGG	2	6	1830	1835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182682736
40	NC_010579	CGT	2	6	1847	1852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682736
41	NC_010579	CATG	2	8	1915	1922	25 %	25 %	25 %	25 %	182682736
42	NC_010579	TCA	2	6	1924	1929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682736
43	NC_010579	CGC	2	6	1997	2002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182682736
44	NC_010579	AATGG	2	10	2011	2020	40 %	20 %	40 %	0 %	182682736
45	NC_010579	CCTTG	2	10	2032	2041	0 %	40 %	20 %	40 %	182682736
46	NC_010579	GAGTAA	2	12	2101	2112	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	182682736
47	NC_010579	CTG	2	6	2306	2311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682736
48	NC_010579	GAA	2	6	2330	2335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182682736
49	NC_010579	TGAG	2	8	2340	2347	25 %	25 %	50 %	0 %	182682736
50	NC_010579	CTG	2	6	2366	2371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682736
51	NC_010579	TGA	2	6	2377	2382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682736
52	NC_010579	CA	3	6	2402	2407	50 %	0 %	0 %	50 %	182682736
53	NC_010579	GAA	3	9	2449	2457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182682736
54	NC_010579	CAT	2	6	2518	2523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682736
55	NC_010579	ATC	2	6	2630	2635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682736
56	NC_010579	ACT	3	9	2658	2666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682736
57	NC_010579	TGA	2	6	2833	2838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682736
58	NC_010579	AGC	2	6	2866	2871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682736
59	NC_010579	GAA	2	6	2901	2906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182682737
60	NC_010579	AAT	2	6	2979	2984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182682737
61	NC_010579	AGGT	2	8	2996	3003	25 %	25 %	50 %	0 %	182682737
62	NC_010579	TCG	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682737
63	NC_010579	GCTT	2	8	3014	3021	0 %	50 %	25 %	25 %	182682737
64	NC_010579	TGC	2	6	3039	3044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682737
65	NC_010579	GGT	2	6	3049	3054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182682737
66	NC_010579	CAG	2	6	3100	3105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682737
67	NC_010579	GAAA	2	8	3321	3328	75 %	0 %	25 %	0 %	182682737
68	NC_010579	CAG	2	6	3388	3393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682737
69	NC_010579	TC	3	6	3448	3453	0 %	50 %	0 %	50 %	182682737
70	NC_010579	ATG	2	6	3469	3474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682737
71	NC_010579	TCA	2	6	3533	3538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682737
72	NC_010579	CATTT	2	10	3544	3553	20 %	60 %	0 %	20 %	182682737
73	NC_010579	GAC	2	6	3721	3726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682738
74	NC_010579	GGC	2	6	3736	3741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182682738
75	NC_010579	GCAA	2	8	3831	3838	50 %	0 %	25 %	25 %	182682738
76	NC_010579	TG	3	6	3849	3854	0 %	50 %	50 %	0 %	182682738
77	NC_010579	TGC	2	6	3858	3863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682738
78	NC_010579	AGCC	2	8	3939	3946	25 %	0 %	25 %	50 %	182682738
79	NC_010579	ATA	2	6	3971	3976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182682738
80	NC_010579	ACG	2	6	4013	4018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682738
81	NC_010579	CAC	2	6	4027	4032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182682738
82	NC_010579	CGCA	2	8	4070	4077	25 %	0 %	25 %	50 %	182682738
83	NC_010579	CAT	2	6	4279	4284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682738
84	NC_010579	CAA	2	6	4304	4309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182682738
85	NC_010579	GTC	2	6	4331	4336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682738
86	NC_010579	GAT	2	6	4361	4366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682738
87	NC_010579	ATG	2	6	4510	4515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682739
88	NC_010579	TGCT	2	8	4526	4533	0 %	50 %	25 %	25 %	182682739
89	NC_010579	CATG	2	8	4560	4567	25 %	25 %	25 %	25 %	182682739
90	NC_010579	GCG	2	6	4576	4581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182682739
91	NC_010579	CCGC	2	8	4645	4652	0 %	0 %	25 %	75 %	182682739
92	NC_010579	GCA	2	6	4699	4704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682739
93	NC_010579	GAAA	2	8	4721	4728	75 %	0 %	25 %	0 %	182682739
94	NC_010579	CCGCAG	2	12	4753	4764	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	182682739
95	NC_010579	GCG	2	6	4783	4788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182682739
96	NC_010579	GCG	2	6	5035	5040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182682740
97	NC_010579	TCG	2	6	5042	5047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682740
98	NC_010579	TCA	2	6	5065	5070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682740
99	NC_010579	ATTG	2	8	5102	5109	25 %	50 %	25 %	0 %	182682740
100	NC_010579	AAT	2	6	5133	5138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182682740
101	NC_010579	GAA	3	9	5174	5182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182682740
102	NC_010579	ATT	2	6	5235	5240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182682740
103	NC_010579	CAA	2	6	5306	5311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182682740
104	NC_010579	CAC	2	6	5320	5325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182682740
105	NC_010579	TGA	2	6	5372	5377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682740
106	NC_010579	ACA	2	6	5378	5383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182682740
107	NC_010579	CAG	2	6	5403	5408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682740
108	NC_010579	GAG	2	6	5491	5496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182682740
109	NC_010579	GAA	2	6	5526	5531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182682740
110	NC_010579	CGA	2	6	5567	5572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682740
111	NC_010579	GCA	2	6	5577	5582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682740
112	NC_010579	AG	3	6	5660	5665	50 %	0 %	50 %	0 %	182682740
113	NC_010579	CAA	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182682740
114	NC_010579	CAA	2	6	5726	5731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182682740
115	NC_010579	GCG	2	6	5830	5835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182682740
116	NC_010579	ACA	2	6	5947	5952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182682740
117	NC_010579	ATC	2	6	6088	6093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682740
118	NC_010579	CTG	2	6	6120	6125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682740
119	NC_010579	CGT	3	9	6145	6153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682740
120	NC_010579	GAAACA	2	12	6166	6177	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	182682740
121	NC_010579	CCAA	2	8	6194	6201	50 %	0 %	0 %	50 %	182682740
122	NC_010579	AGT	2	6	6207	6212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682740
123	NC_010579	GAT	2	6	6260	6265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682740
124	NC_010579	GAA	2	6	6269	6274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182682740
125	NC_010579	CAT	3	9	6323	6331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682740
126	NC_010579	ACATGA	2	12	6391	6402	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	182682741
127	NC_010579	A	6	6	6413	6418	100 %	0 %	0 %	0 %	182682741
128	NC_010579	TTG	2	6	6460	6465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182682741
129	NC_010579	GCA	2	6	6473	6478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682741
130	NC_010579	CAGTG	2	10	6533	6542	20 %	20 %	40 %	20 %	182682741
131	NC_010579	CAG	2	6	6543	6548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682741
132	NC_010579	CAG	2	6	6573	6578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682741
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257	NC_010579	A	6	6	12479	12484	100 %	0 %	0 %	0 %	182682748
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262	NC_010579	GC	3	6	12694	12699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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393	NC_010579	CGT	2	6	19153	19158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682753
394	NC_010579	AC	3	6	19213	19218	50 %	0 %	0 %	50 %	182682753
395	NC_010579	TCGTC	2	10	19309	19318	0 %	40 %	20 %	40 %	182682753
396	NC_010579	T	7	7	19329	19335	0 %	100 %	0 %	0 %	182682753
397	NC_010579	CCT	2	6	19368	19373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182682754
398	NC_010579	CTTC	2	8	19539	19546	0 %	50 %	0 %	50 %	182682754
399	NC_010579	CAT	2	6	19569	19574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682754
400	NC_010579	ATCA	2	8	19717	19724	50 %	25 %	0 %	25 %	182682754
401	NC_010579	TGC	2	6	19725	19730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682754
402	NC_010579	GTT	2	6	20011	20016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182682754
403	NC_010579	CAGACT	2	12	20022	20033	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	182682754
404	NC_010579	CTT	2	6	20043	20048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182682754
405	NC_010579	CCT	2	6	20099	20104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182682754
406	NC_010579	GGT	2	6	20140	20145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182682754
407	NC_010579	TGC	2	6	20159	20164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682754
408	NC_010579	TCG	2	6	20253	20258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682754
409	NC_010579	TGA	2	6	20270	20275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682754
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412	NC_010579	AG	3	6	20520	20525	50 %	0 %	50 %	0 %	182682754
413	NC_010579	CTT	3	9	20560	20568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182682754
414	NC_010579	TCT	2	6	20681	20686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182682754
415	NC_010579	CGCC	2	8	20689	20696	0 %	0 %	25 %	75 %	182682754
416	NC_010579	ACC	2	6	20713	20718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182682754
417	NC_010579	ACC	2	6	20792	20797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182682754
418	NC_010579	GCGTA	2	10	20863	20872	20 %	20 %	40 %	20 %	182682754
419	NC_010579	CTG	2	6	20879	20884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682754
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423	NC_010579	TGA	2	6	21135	21140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682754
424	NC_010579	TTC	2	6	21205	21210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182682754
425	NC_010579	ATCGT	2	10	21314	21323	20 %	40 %	20 %	20 %	182682754
426	NC_010579	TGA	2	6	21496	21501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682755
427	NC_010579	GTA	2	6	21506	21511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682755
428	NC_010579	GTCA	2	8	21539	21546	25 %	25 %	25 %	25 %	182682755
429	NC_010579	GACC	2	8	21603	21610	25 %	0 %	25 %	50 %	182682755
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431	NC_010579	TCA	2	6	21718	21723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682755
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